O Clube de Pesquisa de Bioinformática TGHN LAC - BioinFar tem como objetivo consolidar fundamentação teórico-prática em química, bioquímica estrutural e simulação computacional, articulada ao contexto biológico de pesquisas, como alicerce para o domínio e a aplicação crítica de metodologias avançadas de docking molecular e dinâmica molecular em investigações científicas de impacto regional e global. O Clube é um ambiente multidisciplinar voltado para a troca de conhecimento, desenvolvimento científico e aplicação prática da bioinformática em diferentes áreas das ciências da vida e da tecnologia.
O clube também se destaca pelo caráter colaborativo e formativo, sendo composto por estudantes de graduação, pós-graduandos, biomédicos, farmacêuticos, pesquisadores e professores. Assim, o Clube promove um espaço em que iniciantes podem aprender com pesquisadores experientes, enquanto profissionais já atuantes têm a oportunidade de compartilhar conhecimentos, discutir projetos e desenvolver novas parcerias científicas. Essa interação entre diferentes perfis acadêmicos e profissionais torna o ambiente mais dinâmico, enriquecendo tanto o aprendizado quanto a produção científica dos participantes.
Sobre o Clube de Pesquisa de Bioinformática:
Modalidade: híbrido.
Idioma: português
Periodicidade: quinzenal
Data do primeiro encontro: 06 de fevereiro de 2026
Membros
O grupo possui 17 participantes, sendo 9 mulheres e 8 homens. A maioria é proveniente do estado do Ceará, enquanto um participante é de Campinas, São Paulo. Entre os integrantes, há profissionais e estudantes das áreas de Biomedicina, Farmácia, Ciências Biológicas, Análise e Desenvolvimento de Sistemas, além de pesquisadores que atuam diretamente com temas como resistência bacteriana, desenvolvimento de anticorpos, microbiologia, biologia molecular e modelagem computacional aplicada às ciências da saúde.
A presença de pessoas com experiência em tecnologia e programação fortalece a capacidade do grupo em lidar com ferramentas computacionais, análise de dados ômicos, construção de pipelines bioinformáticos e interpretação de grandes volumes de dados biológicos. Ao mesmo tempo, os participantes com experiência laboratorial e clínica agregam uma visão aplicada e translacional às discussões, aproximando a bioinformática das demandas reais da pesquisa biomédica e farmacêutica.
Jaime Ribeiro Filho – Coordenador. Fiocruz Ceará | Orcid
Ernesto Caffarena – Mentor e consultor em bioinformática. Pesquisador PROCC, Fiocruz | Orcid
Thiago Mesquita Cândido. Universidade Federal do Ceará; Fortaleza-CE | Orcid
Perspectivas Futuras
As perspectivas futuras do Clube de Bioinformática estão voltadas para a capacitação e desenvolvimento técnico dos integrantes, especialmente considerando que grande parte do grupo ainda está em processo de formação e construção de experiência na área da bioinformática. Um dos principais objetivos é promover o aprendizado coletivo, permitindo que todos os participantes desenvolvam conhecimentos teóricos e práticos sobre ferramentas computacionais aplicadas à pesquisa científica.
Entre as metas do grupo, destaca-se o desenvolvimento da capacidade dos integrantes em realizar e compreender análises de docking molecular, desde os fundamentos teóricos até a interpretação dos resultados, contribuindo para aplicações em áreas como desenvolvimento de fármacos, resistência bacteriana, interação proteína-ligante e biologia estrutural computacional.
Além da formação técnica, o clube também busca incentivar a produção científica colaborativa, estimulando a elaboração e publicação de artigos científicos, bem como a participação em congressos, simpósios e eventos acadêmicos representando o grupo. Dessa forma, espera-se fortalecer tanto a formação acadêmica quanto a experiência científica e profissional dos integrantes, consolidando o Clube de Bioinformática como um espaço de aprendizado, colaboração e crescimento científico.
Reuniões do Clube
Reunião 1 (30/05/2026) — Introdução ao Linux para Bioinformática
Objetivos
Entender o que é Linux
Diferença entre Linux, Windows e macOS
Por que Linux domina bioinformática
Conteúdo
Terminal
Estrutura de diretórios
Navegação básica
Comandos
pwd, ls, cd, mkdir, rm, cp, mv
Atividade prática
Criar pastas de projeto
Organizar arquivos de docking
Reunião 2 (13/06/2026) — Linux Aplicado à Bioinformática
Conteúdo
Permissões
Instalação de programas
Variáveis de ambiente
Manipulação de arquivos
Comandos
chmod, grep, cat, head, tail, find
Aplicação prática
Buscar arquivos .pdb
Organizar resultados
Automatizar pequenas tarefas
Reunião 3 (27/06/2026) — Introdução à Bioinformática Estrutural e Docking
Objetivos
O que é bioinformática estrutural
O que é docking molecular
Diferença entre docking, dinâmica molecular e QSAR
Workflow geral de um projeto
Ferramentas apresentadas
PyMol, AutoDock, Avogadro, GAMESS
Discussões
Aplicações farmacológicas
Descoberta de fármacos
Resistência bacteriana
Limitações do docking
Reunião 4 (11/07/2026) — Grupos Funcionais da Química Orgânica
Conteúdo
Hidroxila
Carbonila
Carboxila
Aminas
Amidas
Tióis
Aromáticos
Heterociclos
Foco no docking
Como grupos funcionais influenciam polaridade
Interação
Afinidade
Protonação
Atividade
Identificação de grupos funcionais em fármacos reais
Reunião 5 (25/07/2026) — Aminoácidos: Estrutura e Classificação
Conteúdo
Aminoácidos polares e apolares
Carregados positivos e negativos
Aromáticos
Hidrofóbicos
Aplicação
Como resíduos interagem com ligantes
Sítios ativos
Ferramenta
Visualização no PyMol
Reunião 6 (08/08/2026) — Estrutura de Proteínas
Conteúdo
Estrutura primária
Secundária
Terciária
Quaternária
Conceitos importantes
Folding
Domínios
Motivos estruturais
Aplicação
Reconhecimento de bolsões catalíticos
Flexibilidade proteica
Reunião 7 (22/08/2026) — Interações Intermoleculares I
Conteúdo
Ligações de hidrogênio
Interações hidrofóbicas
van der Waals
Aplicação prática
Como interpretar poses no docking
Exercício
Análise visual de complexos proteína-ligante
Reunião 8 (05/09/2026) — Interações Intermoleculares II
Conteúdo
Pi stacking
Cátion-pi
Pontes salinas
Discussão
Importância energética
Estabilidade do complexo
Ferramenta
PyMol
Reunião 9 (19/09/2026) — Campo de Força e Energia Molecular
Conteúdo
Conceito de campo de força
Energia potencial
Minimização energética
Campos de força
AMBER, CHARMM, GROMOS
Discussão crítica
Limitações dos modelos clássicos
Reunião 10 (03/10/2026) — Otimização de Geometria
Conteúdo
Mecânica clássica vs mecânica quântica
Minimização estrutural
Programas
Avogadro, GAMESS
Atividade prática
Otimização de um ligante simples
Reunião 11 (17/10/2026) — Introdução ao Python para Bioinformática
Conteúdo
Variáveis
Loops
Manipulação de arquivos
Bibliotecas
Pandas, RDKit
Aplicação
Automação de análise de docking
Reunião 12 (31/10/2026) — Introdução ao PyMol
Conteúdo
Carregar proteínas
Representações estruturais
Identificação de resíduos
Aplicação
Visualização de sítios ativos
Medidas de distância
Reunião 13 (07/11/2026) — Preparação de Ligantes
Conteúdo
Estruturas 2D → 3D
Protonação
Minimização
Ferramentas
Avogadro, OpenBabel
Discussão importante
Erros comuns que invalidam docking
Reunião 14 (21/11/2026) — Preparação de Proteínas
Conteúdo
Remoção de água
Correção estrutural
Adição de hidrogênios
Ferramenta
AutoDock Tools
Reunião 15 (05/12/2026) — Grid Box e Sítio Ativo
Conteúdo
O que é grid box
Como definir coordenadas
Blind docking vs focused docking
Ferramenta
PyMol + AutoDock
Reunião 16 (06/02/2027) — Introdução ao AutoDock 4
Conteúdo
Arquivos .pdbqt
Conversão de tipos atômicos
Configuração do docking
Discussão
Algoritmo genético
Score de afinidade
Reunião 17 (20/02/2027) — Execução de Docking Molecular
Objetivos
Gerar poses
Interpretar energia
Avaliar RMSD
Atividade prática
Rodar docking completo
Reunião 18 (06/03/2027) — Interpretação dos Resultados
Conteúdo
Afinidade de ligação
Interações relevantes
Falsos positivos
Discussão crítica
Por que energia baixa nem sempre significa melhor composto
Reunião 19 (20/03/2027) — Automação e Análise de Dados
Conteúdo
Scripts simples
Organização de resultados
Filtragem de poses
Bibliotecas
Pandas, RDKit
Reunião 20 (03/04/2027) — Limitações do Docking Molecular
Discussão avançada
Flexibilidade proteica
Solvente
Protonação
Dependência do campo de força
Objetivo
Desenvolver pensamento crítico científico
Reunião 21 (17/04/2027) — Seminários dos Participantes