El Club de Investigación en Bioinformática TGHN LAC - BioinFar tiene como objetivo consolidar fundamentación teórico-práctica en química, bioquímica estructural y simulación computacional, articulada al contexto biológico de investigaciones, como base para dominar y aplicar críticamente metodologías avanzadas de docking molecular y dinámica molecular en investigaciones científicas de impacto regional y global. El Club es un entorno multidisciplinario enfocado en el intercambio de conocimiento, desarrollo científico y aplicación práctica de la bioinformática en diferentes áreas de las ciencias de la vida y la tecnología.
El club también destaca por su carácter colaborativo y formativo, siendo compuesto por estudiantes de grado, estudiantes de posgrado, biomédicos, farmacéuticos, investigadores y profesores. Así, el Club promueve un espacio donde los principiantes pueden aprender de investigadores experimentados, mientras que profesionales ya actuantes tienen la oportunidad de compartir conocimientos, discutir proyectos y desarrollar nuevas colaboraciones científicas. Esta interacción entre diferentes perfiles académicos y profesionales hace el entorno más dinámico, enriqueciendo tanto el aprendizaje como la producción científica de los participantes.
Acerca del Club de Investigación en Bioinformática:
Modalidad: híbrida.
Idioma: portugués
Periodicidad: quincenal
Fecha del primer encuentro: 6 de febrero de 2026
Miembros
El grupo posee 17 participantes, siendo 9 mujeres y 8 hombres. La mayoría proviene del estado de Cearā, mientras que un participante es de Campinas, São Paulo. Entre los integrantes, hay profesionales y estudiantes de las áreas de Biomedicina, Farmacia, Ciencias Biolōgicas, Análisis y Desarrollo de Sistemas, además de investigadores que actúan directamente con temas como resistencia bacteriana, desarrollo de anticuerpos, microbiología, biología molecular y modelado computacional aplicado a las ciencias de la salud.
La presencia de personas con experiencia en tecnología y programación fortalece la capacidad del grupo para tratar con herramientas computacionales, análisis de datos ōmicos, construcción de tuberías bioinformáticas e interpretación de grandes volúmenes de datos biolōgicos. Al mismo tiempo, los participantes con experiencia de laboratorio y clínica aportan una visión aplicada y traslacional a las discusiones, acercando la bioinformática a las demandas reales de la investigación biomédica y farmacéutica.
Jaime Ribeiro Filho – Coordinador. Fiocruz Cearā | Orcid
Ernesto Caffarena – Mentor y asesor en bioinformática. Investigador PROCC, Fiocruz | Orcid
Thiago Mesquita Cândido. Universidad Federal del Cearā; Fortaleza-CE | Orcid
Perspectivas Futuras
Las perspectivas futuras del Club de Bioinformática se orientan hacia la capacitación y desarrollo técnico de los integrantes, especialmente considerando que gran parte del grupo se encuentra aún en proceso de formación y construcción de experiencia en el área de la bioinformática. Uno de los principales objetivos es promover el aprendizaje colectivo, permitiendo que todos los participantes desarrollen conocimientos teóricos y prácticos sobre herramientas computacionales aplicadas a la investigación científica.
Entre las metas del grupo destaca el desarrollo de la capacidad de los integrantes para realizar y comprender análisis de docking molecular, desde los fundamentos teóricos hasta la interpretación de resultados, contribuyendo a aplicaciones en áreas como desarrollo de fármacos, resistencia bacteriana, interacción proteína-ligando y biología estructural computacional.
Además de la capacitación técnica, el club también busca incentivar la producción científica colaborativa, estimulando la elaboración y publicación de artículos científicos, así como la participación en congresos, simposios y eventos académicos representando al grupo. De esta forma, se espera fortalecer tanto la formación académica como la experiencia científica y profesional de los integrantes, consolidando el Club de Bioinformática como un espacio de aprendizaje, colaboración y crecimiento científico.
Reuniones del Club
Reunión 1 (30/05/2026) — Introducción a Linux para Bioinformática
Objetivos
Entender qué es Linux
Diferencia entre Linux, Windows y macOS
Por qué Linux domina la bioinformática
Contenido
Terminal
Estructura de directorios
Navegación básica
Comandos
pwd, ls, cd, mkdir, rm, cp, mv
Actividad práctica
Crear carpetas de proyecto
Organizar archivos de docking
Reunión 2 (13/06/2026) — Linux Aplicado a la Bioinformática
Contenido
Permisos
Instalación de programas
Variables de entorno
Manipulación de archivos
Comandos
chmod, grep, cat, head, tail, find
Aplicación práctica
Buscar archivos .pdb
Organizar resultados
Automatizar pequeñas tareas
Reunión 3 (27/06/2026) — Introducción a la Bioinformática Estructural y Docking
Objetivos
Qué es la bioinformática estructural
Qué es el docking molecular
Diferencia entre docking, dinámica molecular y QSAR
Flujo de trabajo general de un proyecto
Herramientas presentadas
PyMol, AutoDock, Avogadro, GAMESS
Discusiones
Aplicaciones farmacológicas
Descubrimiento de fármacos
Resistencia bacteriana
Limitaciones del docking
Reunión 4 (11/07/2026) — Grupos Funcionales de la Química Orgánica
Contenido
Hidroxilo
Carbonilo
Carboxilo
Aminas
Amidas
Tioles
Aromáticos
Heterociclos
Enfoque en docking
Cómo los grupos funcionales influyen en la polaridad
Interacción
Afinidad
Protonación
Actividad
Identificación de grupos funcionales en fármacos reales
Reunión 5 (25/07/2026) — Aminoácidos: Estructura y Clasificación
Contenido
Aminoácidos polares e apolares
Cargados positivos y negativos
Aromáticos
Hidrófobos
Aplicación
Cómo los residuos interactúan con ligandos
Sitios activos
Herramienta
Visualización en PyMol
Reunión 6 (08/08/2026) — Estructura de Proteínas
Contenido
Estructura primaria
Secundaria
Terciaria
Cuaternaria
Conceptos importantes
Plegamiento
Dominios
Motivos estructurales
Aplicación
Reconocimiento de bolsas catalíticas
Flexibilidad proteica
Reunión 7 (22/08/2026) — Interacciones Intermoleculares I
Contenido
Enlaces de hidrógeno
Interacciones hidrófobas
van der Waals
Aplicación práctica
Cómo interpretar poses en docking
Ejercicio
Análisis visual de complejos proteína-ligando
Reunión 8 (05/09/2026) — Interacciones Intermoleculares II
Contenido
Apilamiento pi
Catión-pi
Puentes salinos
Discusión
Importancia energética
Estabilidad del complejo
Herramienta
PyMol
Reunión 9 (19/09/2026) — Campo de Fuerza y Energía Molecular
Contenido
Concepto de campo de fuerza
Energía potencial
Minimización energética
Campos de fuerza
AMBER, CHARMM, GROMOS
Discusión crítica
Limitaciones de modelos clásicos
Reunión 10 (03/10/2026) — Optimización de Geometría
Contenido
Mecánica clásica vs mecánica cuántica
Minimización estructural
Programas
Avogadro, GAMESS
Actividad práctica
Optimización de un ligando simple
Reunión 11 (17/10/2026) — Introducción a Python para Bioinformática
Contenido
Variables
Bucles
Manipulación de archivos
Bibliotecas
Pandas, RDKit
Aplicación
Automatización de análisis de docking
Reunión 12 (31/10/2026) — Introducción a PyMol
Contenido
Cargar proteínas
Representaciones estructurales
Identificación de residuos
Aplicación
Visualización de sitios activos
Medidas de distancia
Reunión 13 (07/11/2026) — Preparación de Ligandos
Contenido
Estructuras 2D → 3D
Protonación
Minimización
Herramientas
Avogadro, OpenBabel
Discusión importante
Errores comunes que invalidan docking
Reunión 14 (21/11/2026) — Preparación de Proteínas
Contenido
Remoción de agua
Corrección estructural
Adición de hidrógenos
Herramienta
AutoDock Tools
Reunión 15 (05/12/2026) — Caja de Cuadrícula y Sitio Activo
Contenido
Qué es una caja de cuadrícula
Cómo definir coordenadas
Docking ciego vs docking enfocado
Herramienta
PyMol + AutoDock
Reunión 16 (06/02/2027) — Introducción a AutoDock 4
Contenido
Archivos .pdbqt
Conversión de tipos atómicos
Configuración del docking
Discusión
Algoritmo genético
Puntuación de afinidad
Reunión 17 (20/02/2027) — Ejecución de Docking Molecular
Objetivos
Generar poses
Interpretar energía
Evaluar RMSD
Actividad práctica
Ejecutar docking completo
Reunión 18 (06/03/2027) — Interpretación de Resultados
Contenido
Afinidad de unión
Interacciones relevantes
Falsos positivos
Discusión crítica
Por qué la energía baja no siempre significa un compuesto mejor
Reunión 19 (20/03/2027) — Automatización y Análisis de Datos
Contenido
Scripts simples
Organización de resultados
Filtrado de poses
Bibliotecas
Pandas, RDKit
Reunión 20 (03/04/2027) — Limitaciones del Docking Molecular
Discusión avanzada
Flexibilidad proteica
Solvente
Protonación
Dependencia del campo de fuerza
Objetivo
Desarrollar pensamiento crítico científico
Reunión 21 (17/04/2027) — Seminarios de los Participantes