Construir capacidad relacionada con tecnologías de vanguardia para mejorar la identificación y vigilancia de patógenos emergentes en la red LAC (Latinoamérica yel Caribe).

•  Establecer un programa de capacitación para mejorar la competencia de los investigadores pertenecientes a Latinoamérica y el Caribe (LAC) en el uso de técnicas moleculares de próxima generación.
•  Brindar herramientas y metodologías biológicas computacionales enfocadas en estudios de metagenómica e identificación de genomas
•  Fortalecer la capacidad técnica relacionada con tecnologías de vanguardia, para mejorar el diagnóstico de patógenos emergentes en la red de Latinoamérica y el Caribe (LAC).

Beatriz Parra, Microbióloga e Inmunóloga, Ph.D.

Tiene formación como microbióloga e inmunóloga con amplia experiencia en virología e inmunología. Inicialmente se entrenó como investigadora con un modelo experimental de enfermedad desmielinizante del sistema nervioso central (SNC) que proporcionó pistas importantes sobre el papel de las citocinas y las células T en la inmunopatogénesis viral. Recientemente su investigación se ha centrado en la fisiopatología y enfoques diagnósticos de enfermedades virales causadas por arbovirus (dengue, zika y virus Chikungunya), retrovirus (VIH) y virus respiratorios. Actualmente, es la líder del Laboratorio de Virología de la Facultad de Salud de la Universidad del Valle y del grupo de investigación VIREM (Virus emergentes y enfermedad). Desde 2002 ha obtenido financiación ininterrumpida para investigación de múltiples financiadores nacionales e internacionales, incluido Universidad del Valle, Colciencias-MinCiencias, Sistema General de Regalías, Wellcome Trust, Unión Europea y NIH.

Diana López, Bióloga, Ph.D.

Bióloga de la Universidad del Valle, Máster en Sistemas de Información Geográfica y Máster en Introducción a la Investigación en Ciencias Agrícolas y Medio Natural; Ph.D, en Ciencias Agrícolas y Medio Natural, Ha centrado sus investigaciones en el área de la bioinformática para análisis de la biodiversidad. Línea de investigación en bioinformática y biología molecular, genética de poblaciones, sistemática, filogeografía, y ecología. Postdoctorado de la Universidad del Valle en el Centro de Investigación e Innovación en Bioinformática y Fotónica (CIBioFI) asociada al proyecto “Análisis de la composición microbiana y diversidad del subsuelo marino del caribe y pacifico colombiano”. Postdoc en el Grupo de Investigación VIREM (Virus Emergentes y Enfermedad) de la Facultad de Salud y finalmente en la Escuela de Medicina de la Universidad de Johns Hopkins, apoyando la Red de Neurovirus emergentes y enfermedades neuro inflamatorias. Actualmente es profesora asociada de la Universidad Nacional De Colombia y pertenece al Grupo de Investigación en Diversidad Biológica y Postdoctoral de la Universidad del Valle, con el grupo VIREM.

Nelson Rivera-Franco, Biólogo Ms Ciencias Biológicas, Ph.D. ©

Biólogo y Magíster en Ciencias Biología de la Universidad del Valle, con experiencia en Genética y Biología Molecular. Actualmente es investigador de la Universidad del Valle y candidato a doctor en Ciencias-Biología de la misma universidad, donde realiza su tesis en Enfermedades Neuro Inflamatorias como el síndrome de Guillan-Barré relacionadas con infecciones virales y bacterianas. Así mismo, se encuentra como investigador de la sección de Genética del Departamento de Biología de la Universidad del Valle y pertenece al Laboratorio en Técnicas y Análisis Ómicos (TAOlab) del Centro de Investigación e Innovación en Bioinformática y Fotónica (CIBioFi), un espacio de investigación en el cual se realizan análisis utilizando datos ómicos obtenidos de secuenciación de siguiente generación (NGS), como también hace parte del grupo Virus Emergentes y Enfermedad (VIREM) de la Universidad del Valle sede San Fernando..

El curso tiene una duración de 40 horas totales, distribuidas en 20 horas sincrónicas y 20 horas de trabajo independiente. Las clases sincrónicas se dictarán los lunes, miércoles y viernes de 6:00 p.m. a 8:00 p.m. y los sábados de 8:00 a.m. a 12:00 m. (hora Colombia, GMT-5), con el acompañamiento de los instructores y monitores del curso, para despejar las dudas de los participantes. Las horas de trabajo independiente se apoyarán de forma asincrónica con ayuda de videos y material entregado a los participantes para su desarrollo.

Las clases sincrónicas serán grabadas y podrán ser consultadas por los participantes de forma asincrónica, adicionalmente los facilitadores enviarán videos relacionados con el tema para revisión. Este curso se fundamenta en la educación virtual siendo las TICs un componente esencial y la interacción con los facilitadores mediante los encuentros sincrónicos y correo electrónico.

•  Secuenciación del genoma humano
•  Introducción a la Bioinformática
•  Fundamentos de bases de datos biológicas.
•  Introducción al análisis de datos de Next Generation Sequencing (NGS)

•  Análisis de Datos de Next Generation Sequencing
•  Genómica
•  Transcriptómica
•  Metagenómica

To build capacity in cutting-edge technologies to improve the identification and surveillance of emerging pathogens across the LAC (Latin America and the Caribbean) network.

•  To establish a training programme to improve the proficiency of researchers in Latin America and the Caribbean (LAC) in the use of next-generation molecular techniques.
•  To provide computational biology tools and methodologies focused on metagenomic studies and genome identification
•  To strengthen technical capacity in cutting-edge technologies to improve the diagnosis of emerging pathogens across the Latin America and the Caribbean (LAC) network.

Beatriz Parra, Microbiologist and Immunologist, Ph.D.

She trained as a microbiologist and immunologist and has extensive experience in virology and immunology. She initially trained as a researcher using an experimental model of demyelinating disease of the central nervous system (CNS), which provided important insights into the role of cytokines and T cells in viral immunopathogenesis. More recently, her research has focused on the pathophysiology and diagnostic approaches to viral diseases caused by arboviruses (dengue, Zika and chikungunya viruses), retroviruses (HIV) and respiratory viruses. She currently leads the Virology Laboratory of the Faculty of Health at Universidad del Valle and the VIREM (Emerging Viruses and Disease) research group. Since 2002, she has received uninterrupted research funding from multiple national and international funders, including Universidad del Valle, Colciencias–MinCiencias, the General Royalties System, Wellcome Trust, the European Union and the NIH.

Diana López, Biologist, Ph.D.

She is a biologist from Universidad del Valle, holds a master’s degree in Geographic Information Systems and a master’s degree in Introduction to Research in Agricultural and Natural Environmental Sciences, and a Ph.D. in Agricultural and Natural Environmental Sciences. Her research has focused on bioinformatics for biodiversity analysis. Her research areas include bioinformatics and molecular biology, population genetics, systematics, phylogeography and ecology. She carried out postdoctoral research at Universidad del Valle’s Centre for Research and Innovation in Bioinformatics and Photonics (CIBioFI), associated with the project “Analysis of microbial composition and diversity of the marine subsurface of the Colombian Caribbean and Pacific”. She subsequently undertook postdoctoral work with the VIREM (Emerging Viruses and Disease) Research Group of the Faculty of Health and, finally, at the Johns Hopkins University School of Medicine, supporting the Emerging Neuroviruses and Neuroinflammatory Diseases Network. She is currently an associate professor at Universidad Nacional de Colombia and is affiliated with the Biological Diversity Research Group and with postdoctoral research at Universidad del Valle through the VIREM group.

Nelson Rivera-Franco, Biologist, MSc in Biological Sciences, Ph.D. ©

He is a biologist and holds a master’s degree in Biological Sciences from Universidad del Valle, with experience in Genetics and Molecular Biology. He is currently a researcher at Universidad del Valle and a doctoral candidate in Biological Sciences at the same university, where his thesis concerns neuroinflammatory diseases such as Guillain–Barré syndrome associated with viral and bacterial infections. He also works as a researcher in the Genetics Section of the Department of Biology at Universidad del Valle and is a member of the Omics Techniques and Analysis Laboratory (TAOlab) at the Centre for Research and Innovation in Bioinformatics and Photonics (CIBioFi), a research facility that performs analyses using omics data obtained through next-generation sequencing (NGS). He is also a member of the Emerging Viruses and Disease (VIREM) group at Universidad del Valle, San Fernando campus.

The course lasts 40 hours in total, consisting of 20 synchronous hours and 20 hours of independent work. Synchronous classes will take place on Mondays, Wednesdays and Fridays from 6:00 p.m. to 8:00 p.m., and on Saturdays from 8:00 a.m. to 12:00 noon (Colombia time, GMT-5), with support from course instructors and teaching assistants to answer participants’ questions. Independent study hours will be supported asynchronously through videos and materials provided to participants for their work.

The synchronous classes will be recorded and made available for participants to review asynchronously. In addition, facilitators will share videos related to the topics for further review. The course is based on virtual education, with information and communication technologies (ICTs) playing an essential role and interaction with facilitators taking place through synchronous meetings and email.

•  Human genome sequencing
•  Introduction to Bioinformatics
•  Fundamentals of biological databases.
•  Introduction to Next Generation Sequencing (NGS) data analysis

•  Next Generation Sequencing data analysis
•  Genomics
•  Transcriptomics
•  Metagenomics

Desenvolver capacidades relacionadas a tecnologias de ponta para melhorar a identificação e a vigilância de patógenos emergentes na rede LAC (América Latina e Caribe).

•  Estabelecer um programa de capacitação para aprimorar as competências dos pesquisadores da América Latina e do Caribe (LAC) no uso de técnicas moleculares de última geração.
•  Fornecer ferramentas e metodologias de biologia computacional voltadas a estudos de metagenômica e identificação de genomas
•  Fortalecer a capacidade técnica relacionada a tecnologias de ponta para melhorar o diagnóstico de patógenos emergentes na rede da América Latina e do Caribe (LAC).

Beatriz Parra, Microbiologista e Imunologista, Ph.D.

Tem formação em microbiologia e imunologia, com ampla experiência em virologia e imunologia. Inicialmente, formou-se como pesquisadora utilizando um modelo experimental de doença desmielinizante do sistema nervoso central (SNC), que forneceu informações importantes sobre o papel das citocinas e das células T na imunopatogênese viral. Recentemente, suas pesquisas têm se concentrado na fisiopatologia e em abordagens diagnósticas de doenças virais causadas por arbovírus (dengue, zika e vírus chikungunya), retrovírus (HIV) e vírus respiratórios. Atualmente, lidera o Laboratório de Virologia da Faculdade de Saúde da Universidad del Valle e o grupo de pesquisa VIREM (Vírus Emergentes e Doença). Desde 2002, recebe financiamento ininterrupto para pesquisas de diversos financiadores nacionais e internacionais, incluindo a Universidad del Valle, Colciencias-MinCiencias, o Sistema Geral de Royalties, o Wellcome Trust, a União Europeia e o NIH.

Diana López, Bióloga, Ph.D.

Bióloga formada pela Universidad del Valle, mestre em Sistemas de Informação Geográfica e mestre em Introdução à Pesquisa em Ciências Agrárias e do Meio Natural; doutora em Ciências Agrárias e do Meio Natural. Concentrou suas pesquisas na área de bioinformática para análise da biodiversidade. Suas linhas de pesquisa incluem bioinformática e biologia molecular, genética de populações, sistemática, filogeografia e ecologia. Realizou pós-doutorado na Universidad del Valle, no Centro de Pesquisa e Inovação em Bioinformática e Fotônica (CIBioFI), associado ao projeto “Análise da composição microbiana e da diversidade do subsolo marinho do Caribe e do Pacífico colombianos”. Também realizou pós-doutorado no Grupo de Pesquisa VIREM (Vírus Emergentes e Doença), da Faculdade de Saúde, e, posteriormente, na Escola de Medicina da Universidade Johns Hopkins, apoiando a Rede de Neurovírus Emergentes e Doenças Neuroinflamatórias. Atualmente, é professora associada da Universidad Nacional de Colombia e integra o Grupo de Pesquisa em Diversidade Biológica e o programa de pós-doutorado da Universidad del Valle, junto ao grupo VIREM.

Nelson Rivera-Franco, Biólogo, Mestre em Ciências Biológicas, Ph.D. ©

Biólogo e mestre em Ciências Biológicas pela Universidad del Valle, com experiência em Genética e Biologia Molecular. Atualmente, é pesquisador da Universidad del Valle e doutorando em Ciências Biológicas na mesma universidade, onde desenvolve sua tese sobre doenças neuroinflamatórias, como a síndrome de Guillain-Barré, relacionadas a infecções virais e bacterianas. Também atua como pesquisador na Seção de Genética do Departamento de Biologia da Universidad del Valle e integra o Laboratório de Técnicas e Análises Ômicas (TAOlab) do Centro de Pesquisa e Inovação em Bioinformática e Fotônica (CIBioFi), um espaço de pesquisa onde são realizadas análises de dados ômicos obtidos por sequenciamento de nova geração (NGS). Além disso, integra o grupo Vírus Emergentes e Doença (VIREM) da Universidad del Valle, campus San Fernando..

O curso tem duração total de 40 horas, distribuídas em 20 horas síncronas e 20 horas de trabalho independente. As aulas síncronas serão ministradas às segundas, quartas e sextas-feiras, das 18h às 20h, e aos sábados, das 8h às 12h (horário da Colômbia, GMT-5), com o acompanhamento dos instrutores e monitores do curso para esclarecer as dúvidas dos participantes. As horas de trabalho independente contarão com apoio assíncrono por meio de vídeos e materiais disponibilizados aos participantes para a realização das atividades.

As aulas síncronas serão gravadas e poderão ser consultadas pelos participantes de forma assíncrona. Além disso, os facilitadores enviarão vídeos relacionados aos temas para revisão. Este curso fundamenta-se na educação virtual, sendo as tecnologias da informação e comunicação (TICs) um componente essencial, com interação entre os participantes e os facilitadores por meio de encontros síncronos e e-mail.

•  Sequenciamento do genoma humano
•  Introdução à Bioinformática
•  Fundamentos de bancos de dados biológicos.
•  Introdução à análise de dados de sequenciamento de nova geração (NGS)

•  Análise de dados de sequenciamento de nova geração
•  Genômica
•  Transcriptômica
•  Metagenômica