El Taller "Introducción a la Bioinformática: Herramientas y Aplicaciones en Salud Global" tiene como objetivos introducir los conceptos fundamentales de la Bioinformática y sus aplicaciones en Salud Global, capacitando a profesionales de las ciencias de la vida para explorar datos públicos (genómicos, transcriptómicos y/o metagenómicos) y estructurar análisis básicos reproducibles orientados a la vigilancia de patógenos, el desarrollo de vacunas y fármacos, y el apoyo a la toma de decisiones en salud pública.
Duración total: 6 días (24 de junio a 1 de julio 2026)
La actividad está organizada por la Universidad Nacional de Colombia, la Fiocruz, la Fundación Etikos, la Universidad del Valle y la Universidad Autónoma de Santo Domingo, con apoyo de The Global Health Network Latin America and the Caribbean y apoyo financiero del Wellcome Trust (Subvención 226688/Z/22/Z).
El objetivo del taller es fortalecer capacidades en el uso de la metodología Pathfinder, un enfoque orientado al mapeo de procesos de investigación, permitiendo identificar desafíos, proponer soluciones y generar aprendizajes transferibles entre estudios. La actividad fue desarrollada en dos sesiones complementarias combinando presentación conceptual, actividad práctica y discusión colectiva, con énfasis en la aplicación directa de las herramientas Pathfinder al contexto real de los estudios del EEAPS.
Objetivos específicos
Al finalizar el curso, se espera que los participantes sean capaces de:
- Explicar el papel de la bioinformática como pilar de la Salud Global, con ejemplos en la vigilancia de patógenos, el desarrollo de vacunas y fármacos, y el análisis de grandes volúmenes de datos ómicos.
- Reconocer los principales tipos de datos biológicos utilizados en Bioinformática (secuencias de ADN/ARN/proteínas, datos de expresión génica, datos metagenómicos, etc.) y sus fuentes públicas.
- Navegar en bases de datos públicas y recuperar conjuntos de datos relevantes para la salud global.
- Describir, a nivel introductorio, los flujos de análisis de secuencias y de datos ómicos.
- Utilizar herramientas computacionales accesibles (por ejemplo, plataformas web o entornos virtuales) para ejecutar etapas básicas de análisis de datos públicos.
- Capacitar al participante para diseñar y proponer flujos de trabajo (pipelines) de análisis bioinformáticos aplicables a proyectos reales, seleccionando las herramientas y bases de datos adecuadas para responder a problemas concretos de Salud Global
Perfil del público objetivo y requisitos técnicos
Están invitados a participar del taller profesionales e investigadores/as con título de grado en áreas de Ciencias de la Vida, tales como: Biología, Biomedicina, Medicina, Farmacia, Enfermería, Salud Pública, Biotecnología y áreas afines. Es recomendable que el público tenga conocimiento básico de Biología Molecular y Celular (por ejemplo: conceptos de gen, genoma, transcripción, traducción, secuencia de ADN/ARN/proteína). No es obligatorio tener conocimientos previos de programación; el curso será introductorio y se centrará en herramientas amigables.
Requisitos técnicos
- Computador individual para cada participante en las sesiones presenciales, con:
- Navegador actualizado (Chrome, Firefox o equivalente)
- Capacidad de acceso a plataformas web (entorno de análisis, bases de datos)
- Acceso estable a internet en las sesiones presenciales (Wi-Fi institucional o equivalente), incluyendo:
- Posibilidad de descarga de archivos de tamaño moderado (secuencias, tablas)
- Acceso no restringido a repositorios y plataformas relevantes
- Se recomienda, en la medida de lo posible, disponer también de:
- Tomas de corriente y extensiones suficientes en la sala
- Proyector o pantalla grande para demostraciones
Metodología
La metodología del curso combinará:
1
Clases expositivas y charlas abiertas
Para contextualizar la Bioinformática en la Salud Global, presentar conceptos fundamentales y mostrar casos reales de aplicación.
2
Demostraciones guiadas en entorno computacional
Demostración, paso a paso, de flujos de análisis (desde la obtención de los datos hasta la visualización de resultados), incentivando su reproducción.
3
Sesiones prácticas "hands-on"
Los participantes trabajarán en su propio computador, siguiendo guías estructuradas y, gradualmente, introduciendo variaciones para responder preguntas específicas.
4
Trabajo basado en proyectos
Desde el inicio, los participantes se organizarán en grupos, para desarrollar un miniproyecto utilizando datos públicos. Este enfoque fomenta la colaboración, la discusión y la construcción colectiva de soluciones.
5
Discusión orientada y retroalimentación continua
Espacios de discusión sobre las limitaciones de los datos, elección de herramientas e interpretación de resultados.
Visión general y contenido programático detallado
24 de junio del 2026
Hora: 8-10am (Hon) / 9-11am (Col) / 10-12 (RD) / 11-1pm (Br)
Formato: Remoto
Mañana: Sesión abierta/Webinar: Introducción a la Bioinformática y Salud Global
25 de junio del 2026
Hora: 8-10am/ 12-2pm (Hon) / 9-11am/ 12-2pm (Col) / 10-12/ 1-3pm (RD) / 11-1pm/ 2-4pm (Br)
Formato: Remoto
Mañana: Teoría: Obtención de datos, fuentes públicas, tipos de archivos y conceptos de secuenciación/ensamblaje/anotación de genomas.
Tarde: Teoría: Análisis de secuencias, alineamientos (par y múltiple) y fundamentos de filogenia molecular
26 de junio del 2026
Hora: 8-10am/ 12-2pm (Hon) / 9-11am/ 12-2pm (Col) / 10-12/ 1-3pm (RD) / 11-1pm/ 2-4pm (Br)
Formato: Remoto
Mañana: Teoría: Introducción a la transcriptómica y metagenómica - diseño experimental, flujo de análisis y control de calidad
Tarde: Teoría: Bioinformática estructural y modelado molecular. Definición de los grupos y temas para los miniproyectos
29 de junio del 2026
Hora: 9am - 4pm (RD)
Formato: Presencial
Mañana: Práctica guiada: Exploración de bases de datos, descarga de secuencias y ejecución de alineamientos/filogenia
Tarde: Práctica guiada: Análisis práctico de ensamblaje y anotación de genomas
30 de junio del 2026
Hora: 9am - 4pm (RD)
Formato: Presencial
Mañana: Práctica guiada: modelado molecular – obtención y análisis de estructuras 3D de proteínas a partir de secuencias
Tarde: Desarrollo intensivo y acompañamiento de los miniproyectos (Mentoría)
1 de julio del 2026
Hora: 9am - 4pm (RD)
Formato: Presencial
Mañana: Presentación de los miniproyectos
Tarde: Presentación de los miniproyectos
Fase 1: Fundamentos Teóricos (Remoto)
Día 2 – Genómica y Evolución (Mañana y Tarde)
- Gestión de Datos Biológicos: Fuentes de datos públicas (NCBI, EBI), tipos de archivo (FASTA, FASTQ, GFF, PDB etc) e interpretación de la calidad de secuenciación.
- Ensamblaje y Anotación: Flujos de trabajo para ensamblaje de novo y por referencia; identificación de regiones codificantes y funciones génicas.
- Filogenia Molecular: Teoría del alineamiento de secuencias (par e múltiple), matrices de sustitución y construcción de árboles filogenéticos.
Día 3 – Ómicas y Estructura (Mañana y Tarde)
- Transcriptómica y Metagenómica: Diseño experimental, control de calidad, mapeo contra genomas de referencia y cuantificación de la expresión génica.
- Bioinformática Estructural: Relación secuencia-estructura-función, visualización de estructuras 3D y su aplicación en el diseño de fármacos y vacunas.
- Definición de Microproyectos: Metodología para la elección de la pregunta biológica y selección de conjuntos de datos reales.
Fase 2: Inmersión Práctica y Proyectos (Presencial en RD)
Día 5 – Modelado y Desarrollo de Proyectos (Mañana y Tarde)
- Hands-on III: Uso de servidores de predicción estructural (ej. AlphaFold2, Swiss-Model) e interpretación de modelos proteicos 3D.
- Mentoría Intensiva: Trabajo grupal guiado para la construcción de los pipelines de análisis específicos para los microproyectos de Salud Global.
Evaluación
La evaluación será formativa y basada en la presentación de miniproyecto que contemple:
- Una pregunta biológica sencilla y relevante para la Salud Global (por ejemplo: comparación entre linajes de un patógeno; exploración de un pequeño conjunto de datos transcriptómicos/metagenómicos; análisis exploratorio de datos de vigilancia).
- Selección de un conjunto de datos público asociado a la pregunta.
- Definir y ejecutar un flujo de análisis adecuado utilizando las herramientas discutidas en el curso.
- Presentación oral
Certificación
La certificación del curso se divide en dos modalidades, según los diferentes niveles de participación:
- Certificación Completa (Presencial + Remoto): Se otorgará a los participantes que completen la carga horaria total (6 días = 48 horas), incluyendo las sesiones teóricas virtuales y las prácticas presenciales en República Dominicana con la presentación del proyecto final.
- Microcertificación (Online): Se otorgará a los alumnos que sigan exclusivamente la modalidad remota (Días 1, 2 e 3 = 24 horas), certificando la adquisición de conocimientos teóricos y fundamentos de Bioinformática